5 老师你好,我想问几个关于无参转录组的问题

我现在研究的昆虫在NCBI上还没有完整的基因组,搜索我所研究的昆虫也几乎没有什么基因,但是同一个目 的昆虫有比较深入的研究了。这是前提。
正在着手测基因组,但前期测了一个无参的转录组,从中挑选并得到一段序列,公司标注这是cds区的序列
1、我可以利用这段序列用DNAMAN翻译成氨基酸序列并进行后续的预测吗?这准确吗?
2、我用DNAMAN翻译的序列和用NCBI上查到的ORF区序列不太一样,我后续预测理化性质什么的话,我用哪一段比较好呢?

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桂圆儿

你好,不清楚你的序列是功能基因吗?功能基因的话之后的功能分析直接用核算序列不需要蛋白序列,如果是做后续理化性质分析直接用核酸序列就可以,或者用NCBI上预测的结果进行分析

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  • 陈尾翼 提出于 2022-07-01 11:08

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