染色体挂载:LACHESIS 安装

染色体挂载:LACHESIS 安装
export LACHESIS_BOOST_DIR=
export LACHESIS_SAMTOOLS_DIR=/share/work/biosoft/samtools/samtools-0.1.19/


./configure --prefix=/share/work/biosoft/LACHESIS/ --with-samtools=/share/work/biosoft/samtools/samtools-0.1.19/? --with-boost=/share/work/biosoft/boost/boost.1.57


#报错:


SAMStepper.cc:32:21: fatal error: bam/sam.h: No such file or directory

?#include <bam/sam.h>

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?^

compilation terminated.



修改这两个文件指定文件路径:?SAMStepper.cc? ?SAMStepper.h


attachments-2022-07-NyxJnF1362cfa5e6c97b7.png

attachments-2022-07-HnKkgmg062cfa60342073.png







boost



wget http://sourceforge.net/projects/boost/files/boost/1.57.0/boost_1_57_0.tar.gz --no-check-certificate


./bootstrap.sh --prefix=/share/work/biosoft/boost/boost.1.57 --with-libraries=all


./b2 install

./bjam install

  • 发表于 2022-07-12 13:40
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